納稅義務人綜合所得稅結算申報列報醫藥及生育費扣除額時，應注意本人及其配偶或受扶養親屬之醫藥費及生育費，以付與公立醫院、全民健康保險特約醫療院、所，或經財政部認定其會計紀錄完備正確之醫院者為限，並應檢附醫療院所開立之收據正本，單據如已繳交服務機關申請補助者，須檢附經該機關證明之收據影本申請扣除。但受有保險給付部分，不得扣除。
進一步說明，所得稅法第17條第1項第2款第2目之3所定醫藥及生育費列舉扣除額之立法意旨，係針對人民因身體病痛接受治療而支付的費用，因屬生活中之必要支出，故於計算所得淨額時予以扣除，惟以該等醫藥費用係支付予合於前揭規定之公立醫院、全民健康保險特約醫療院、所，或經財政部認定其會計紀錄完備正確之醫院者為限，始得扣除。又倘因病情需要急須使用該院所無之特種藥物，而自行購買使用者，其藥費可憑：(一)該醫院、診(療)所之住院或就醫證明。(二)主治醫師出具准予外購藥名、數量之證明。(三)書明使用人為抬頭之統一發票或收據，申報醫藥及生育費列舉扣除。
舉例說明，甲君109年度列報受扶養親屬乙君之醫藥及生育費扣除額12萬元，經該局以不符合稅法規定，予以剔除該筆醫藥及生育費扣除額，甲君不服，主張受扶養親屬乙君因發展遲緩，經醫院出具證明書且建議進行相關之復健療程，其確實有進行復健治療之必要性，取具依法設立之復健院所開立之復健費用收據，應准予減除等，申請復查，經該局以A診所既非公立醫院，亦非全民健康保險特約醫事服務機構，且非屬財政部認定會計紀錄完備正確之診所，不符合前揭所得稅法規定，予以復查駁回。
特別提醒納稅義務人，綜合所得結算申報時應注意列舉符合醫藥及生育費扣除額要件之支付證明文件，以保障自身權益。
