營利事業短漏報課稅所得額，應就短漏之所得額依當年度適用營利事業所得稅稅率計算之漏稅額，處以2倍（已申報案件）或3倍（未申報案件）以下之罰鍰，如營利事業因受獎勵免稅或營業虧損，致加計短漏之所得額後仍無應納稅額者，依所得稅法第110條第3項規定，仍應就短漏之所得額依適用稅率計算之金額，依規定倍數處罰，但最高不得超過90,000元，最低不得少於4,500元。
日前查核甲公司107年度營利事業所得稅結算申報案，認定甲公司虛報營業費用700萬元，經剔除該筆費用後，雖核定全年所得額及課稅所得額仍為虧損並無應納稅額，惟依所得稅法第110條第3項規定，仍應就短漏之所得額700萬元依當年度適用之營利事業所得稅稅率計算之金額140萬元（700萬元×20%）處以2倍以下罰鍰，但依前揭規定罰鍰最高不得超過90,000元，故裁處罰鍰金額為90,000元。
所得稅法第110條第3項規定主要目的在維護誠實自動申報制度，確保善良納稅風氣，故針對營利事業因受獎勵免稅或營業虧損，經加計查獲之短漏報所得後仍無應納稅額者，依法仍會遭受處罰，提醒營利事業特別留意。